Рудик Бем, добрый вечер!
Цитата: 1. По договору простого товарищества (договору о совместной деятельности) двое или несколько лиц (товарищей) обязуются соединить свои вклады и совместно действовать без образования юридического лица для извлечения прибыли или достижения иной не противоречащей закону цели.2.Сторонами договора простого товарищества, заключаемого для осуществления предпринимательской деятельности, могут быть только индивидуальные предприниматели и (или) коммерческие организации.
Цитата: планируем заключить договор о совместно осуществляемых операциях по выращиванию с/х культур с ФГБУ
ФГБУ - это, насколько я понимаю, федеральное государственное бюджетное учреждение, таким образом, оно не может выступать стороной договора простого товарищества.
помимо этого, обращаю внимание на Постановление ФАС СЗО № А13-11862/2006-16 от 20.07.2007, в нем указано: "Кроме того, поскольку УВД является учреждением, кассационная инстанция считает, что оспариваемый договор заключен в нарушение пункта 2 статьи 1041 ГК РФ, согласно которому сторонами договора простого товарищества, заключаемого для осуществления предпринимательской деятельности, могут быть только индивидуальные предприниматели и (или) коммерческие организации.
В связи с тем, что целью договора от 24.01.05 о совместной деятельности, как указано в пункте 1.1 договора, является строительство автотехнического комплекса и получение в собственность помещений данного комплекса, нет оснований считать, что он заключен для осуществления не предпринимательской деятельности.
Как предусмотрено статьей 168 ГК РФ, сделка, не соответствующая требованиям закона или иных правовых актов, ничтожна."
таким образом, перед проблемой в части НДС необходимо решить законность самой сделки.